La polisomnografía es el estudio a realizar para ahondar en la patología del sueño.

En ella se evalúan los movimientos oculares, el electroencefalograma, se realiza electromiograma de mentón, brazos y piernas, flujo aéreo (respiración buco nasal), electrocardiograma, oximetría de pulso y los sonidos por medio de un micrófono.

El electroencefalograma es indispensable para diagnosticar las etapas de sueño REM no REM. El hipnograma es un gráfico en el cual se representa el estado de vigilia y las distintas etapas del sueño. Los ciclos del sueño REM y no REM tienen una duración aproximada de 90 a 120 minutos. Durante el comienzo de la noche el porcentaje de sueño profundo es mayor y con el correr de las horas el sueño REM aumenta. La duración de cada etapa depende de la edad y el estado farmacológico del sujeto. El sueño REM resulta ser el 18% al 20% del tiempo total del sueño. Con la edad disminuye el sueño profundo.

Puede que los trastornos de la respiración produzcan múltiples despertares. En este tiempo pueden producirse des saturaciones de oxígeno. Este cuadro puede acompañarse de ronquidos y un body mass index elevado (normal:20-25, aceptable:25-30 y de riesgo:30-35). Este tipo de pacientes suelen presentar somnolencia diurna y provocar accidentes, e incluso puede que este sea el motivo de consulta o bien que se queje por bajo rendimiento diurno. Paralelamente la hipoxemia crónica produce poliglobulia. Estos pacientes no son pasibles de cirugía, sino de tratamiento clínico. La apnea puede ser de causa obstructiva (en la cual existen movimientos respiratorios, pero hay una obstrucción de vía aérea), de causa central o mixta.

Es muy común que las reacciones de despertar no se relacionen con apnea sino con reflujo gastroesofágico. En otros casos de pacientes con Cheines-Stokes en los cuales existe obesidad sobreagregada puede que empeoren sus apneas por restriccón sobreagregada. En estos casos puede ser de utilidad un CIPAP. Otra causa de trastornos del sueño son las arritmias cardíacas, que producen reacciones de despertar. Existe un índice que es el índice de apnea-hipopnea o de perturbación respiratoria, siendo el valor normal de 10.